U biologiji, za opisivanje određenog organizma, koji pripada kraljevstvu životinja, gljiva ili biljaka, razvijena je vlastita nomenklatura. Odražava pripadnost jednoj vrsti, ovisno o karakteristikama morfologije i izgleda. Za životinje se primjenjuju kriteriji za označavanje vrste, ovisno o sposobnosti stvaranja plodnog potomstva tijekom oplodnje. Međutim, ti se obrasci odnose samo na te organizme, dok se mikrobi ne mogu klasificirati na ovaj način.
Koncept soja u mikrobiologiji
Zbog prisutnosti velikog broja organizama koji imaju morfološka svojstva, ali različite biokemijske i imunološke značajke, nemoguće je primijeniti standardnu nomenklaturu za imenovanje. Kao rezultat toga, uveden je koncept kao što je soj. Ovo je čista kultura mikroba koja je izolirana i izolirana na određenom mjestu u određeno vrijeme.
Svaki mikrob koji pripada jednom soju sličan je drugom takvom predstavniku u smislu biokemijskih, morfoloških, imunoloških i genetskih kriterija. Ali unutar iste bakterijske vrste takva se analogija ne opaža. Stoga je soj fleksibilniji naziv za mikrobnu kulturu. Jer brzorazmjena genetskog materijala (mutacija) dovodi do pojave novih organizama unutar vrste, ali s različitim svojstvima, upravo ta definicija omogućuje nam točniju karakterizaciju čimbenika patogenosti i virulencije.
Bakterijski sojevi
Postojeća nomenklatura bakterija omogućuje klasifikaciju vrsta organizama, ali ne karakterizira njihova nova svojstva. Potonji se pojavljuju kao rezultat brze mutacije, stječući nova svojstva, uključujući ona patogena za ljude, domaće životinje i biljke, kao i druge mikrobe. Primjer nomenklature na primjeru Escherichia coli izgleda ovako: kraljevstvo - bakterije, tip - Proteobacteria, klasa gama-proteobacteria, red - Enterobacteriales, obitelj Enterobacteria. Rod je Escherichia, a vrsta Escherichia colli. Međutim, postoje mnoge kulture bakterija vrste Escherichia colli koje pokazuju različita svojstva. Izolirani su u zasebne sojeve bakterija i imaju dodatno ime. Na primjer, Escherichia colli O157:H7.
E. coli sama je prisutna u ljudskom crijevu i ne uzrokuje bolest, ali soj O157:H7 je isključivo patogen zbog prisutnosti velikog broja čimbenika virulencije. Doživjela je epidemiju enterotoksigenih bolesti u posljednjih 5 godina.
Sojevi virusa
Koncept soja je fleksibilan naziv za organizme s istim svojstvima koji su izolirani, a zatim identificirani i opisani na određenom području u određeno vrijeme. Svojim tijekom virus može steći nova svojstva zbog antigenazanositi. To će stvoriti novi virusni soj, vjerojatno patogeniji od svog roditelja.
Možete jasno pokazati pojavu novih sojeva na primjeru virusa gripe. Pripada obitelji ortomiksovirusa, a naziv je dobio ovisno o antigenima (hemaglutinini i neuraminidaza) HxNy. X i Y su numeričke vrijednosti koje odražavaju prisutnost antigena. Primjer je H5N1, poznat po nedavnoj epidemiji svinjske gripe s brzo progresivnim hemoragijskim pneumonijama. Prema teoriji, iz ovog se soja može razviti novi i opasniji soj zbog istog antigenskog drifta.
Gljivični sojevi i protisti
Plijesni su najmanje varijabilne od svih mikroba, iako je njihova biokemija također složena. Zbog složenije strukture od bakterija i virusa, a također i zbog nedostatka mehanizama za brzi prijenos gena, broj novih sojeva gljivica se neznatno povećava. Također postoji mišljenje da je svaki novootkriveni soj gljivica već postojeći organizam koji istraživačima jednostavno nije došao.
Slična situacija postoji u kraljevstvu protista. Njihova sposobnost mutiranja je niska, pa je vjerojatnost da će se novi sojevi brzo pojaviti iznimno mala. Međutim, i dalje se pojavljuju nove varijante organizama iste vrste. Stoga su, očito, postojali i ranije, ali nisu otkriveni.
